quinta-feira, 14 de maio de 2020

O que é o número de reprodução R?

Entre as incontáveis cifras e termos estatísticos que pululam em meio à pandemia de covid-19, tem-se destacado a letra "R". Definido por quatro variáveis, esse índice expressa o potencial de propagação do coronavírus.

O número efetivo de reprodução R designa o potencial de propagação de um vírus dentro de determinadas condições. Se ele é superior a 1, cada paciente transmite a doença a pelo menos mais uma pessoa, e o vírus se dissemina. Se é menor do que 1, cada vez menos indivíduos se infectam e o número dos contágios retrocede. Portanto, para coibir o alastramento de um patógeno, o número de reprodução deve estar abaixo de 1 (ou R < 1, em termos matemáticos).

O epidemiologista Adam Kucharski desenvolve modelos matemáticos de moléstias infecciosas, para entender melhor sua progressão, e explica os fatores envolvidos. Esse conhecimento, por sua vez, pode ajudar políticos a tomarem decisões que visam restringir a propagação de uma doença – e podem deixar os cidadãos responsáveis temendo por seus direitos à liberdade.

QUATRO  FATORES DE AJUSTE
Antes de se ocupar da covid-19, Kucharski já pesquisara enfermidades como ebola, Sars e gripe. Para descrever o potencial de contágio de uma doença, em seu livro The rules of contagion: Why things spread – and why they stop (As regras do contágio: Por que as coisas se espalham – e porque param) ele define quatro parâmetros, cujas iniciais em inglês formam o acróstico DOTS (pontos).

·    Duration (duração): Indica a duração da infecciosidade. Quanto mais tempo alguém fica doente, mais pode contagiar outros; quanto mais cedo for isolado, menos tempo tem para transmitir o vírus. Problemático no caso do Sars-cov-2 é que aparentemente os pacientes já são contagiosos dois a três dias antes de apresentar sintomas.

·    Opportunity (oportunidade): Com quantas pessoas o infectado teve contato que permita ao vírus passar para elas? Segundo Adam Kucharski e equipe, sob condições normais isso ocorre uma média de cinco vezes por dia. Essa variável praticamente traça o comportamento social de cada um: ela é redutível, por exemplo, aumentando o distanciamento social ou só fazendo um aceno como saudação, em vez de abraçar.

·    Transmission probability (probabilidade de transmissão): Quando dois indivíduos se encontram, quão provável é que o vírus seja efetivamente transmitido de um a outro? Kucharski calcula que isso pode acontecer uma vez em cada três oportunidades.

·    Susceptibility (suscetibilidade): Havendo tempo, oportunidade e probabilidade de transmissão, quão provável é que a outra pessoa vá contrair o vírus e adoecer em consequência? Como até o momento não existe uma vacina contra o novo coronavírus, e a taxa de contaminação – e, portanto, de imunidade potencial – é bastante baixa, esta variável circula em torno de 100%. À medida que progredir a imunização, ela pode se reduzir, mas provavelmente só cairá significativamente a partir de uma vacinação em massa.

O resto é matemática: a multiplicação de D, O, T e S resulta no número de reprodução R (o termo "taxa de reprodução", também encontrado, é incorreto). Os quatro parâmetros são como "parafusos de ajuste" para impedir a propagação do vírus. Normalmente as vacinas são uma peça essencial, mas como elas ainda não existem, só se pode manipular D, O, T e S: isolar os enfermos, evitar contatos sociais, espirrar na dobra do braço, lavar as mãos.

R NÃO É R0
É preciso distinguir o número efetivo de reprodução R do número básico de reprodução R0. R indica quantos um contagiado infecta, em média, após serem tomadas medidas de contenção ou uma parte da população estar imune. Por sua vez, R0 descreve quantos são infectados sem quaisquer medidas de combate. Portanto R0 parte do princípio que ninguém foi vacinado, ou já teve a doença, tornando-se imune, e que não haja possibilidade de conter a propagação.

O Instituto Robert Koch, responsável na Alemanha pela monitoração de doenças infecciosas estima que o número básico R0 do Sars-cov-2 esteja entre 2,4 e 3,3. Portanto, sem medidas contrárias, cada paciente contaminaria entre dois e três outros cidadãos. Então para que uma epidemia ficar sob controle (ou seja, R < 1), seria necessário evitar cerca de dois terços dos contágios.

As medidas atualmente adotadas visam "achatar a curva" ("flatten the curve", em inglês) dos contágios, para que o número de casos de doença não suplante a capacidade do sistema de saúde, e os médicos não tenham que decidir que pacientes podem tratar e quais devem deixar morrer. Essa dolorosa forma de triagem já ocorreu no norte da Itália, no início do surto. Fonte: Deutsche Welle – 11.05.2020

Coronavírus: Dados Globais da Johns Hopkins University

GLOBAL
Data
Pessoas infectadas
Óbitos
Taxa de letalidade
15/4/2020
2.000.984
128.000
6,40%
23/4/2020
2.625.657
183.026
6,97%
30/4/2020
3.251.925
233.014
7,17%
07.05.2020
3.813.123
267.233
7,00%
14.05.2020
4.399.550
299.333
6,80%

BRASIL
Data
Pessoas infectadas
Óbitos
Taxa de letalidade
15.04.2020
28.320
1.532
5,41
23/04/2020
49.492
3.313
6,69
30.05.2020
85.380
5.901
6,91
07.05.2020
135.106
9.146
6,76
14.05.2020
196.158
13.551
6,91
Fonte: COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU) - 5/14/2020 - 1:32:28 PM

quarta-feira, 13 de maio de 2020

Coronavírus: Quarentena total na Província de Santiago, Chile

 A nova medida foi anunciada nesta manhã devido à rápida disseminação e reaparecimento do vírus em várias comunidades.

O governo tomou uma medida rigorosa nas últimas horas, como resultado do surto de coronavírus que ocorreu em algumas comunas, particularmente no setor leste da capital.

Assim, nesta manhã o Ministro da Saúde, Jaime Mañalich, confirmou que todas as comunas da província da Grande Santiago e mais seis na Região Metropolitana entrarão em quarentena total a partir desta sexta-feira, 15 de maio, às 22:00

Nesta terça-feira, a medida já havia sido renovada por mais sete dias para algumas comunidades, no entanto, como anunciado, toda a região estará sujeita a essa medida a partir deste fim de semana.

O anúncio é interrompido por um aumento explosivo de casos positivos de coronavírus no Chile. Nas últimas 24 horas, encerrando em 12 de maio às 22h, foram registrados 2.660 novos testes positivos.

Assim, o país atingiu suas 34.381 infecções desde a chegada da pandemia. Destes, 14.885 aparecem nos números do Minsal como recuperados.


Nesse dia, haverá 38 comunas com restrições de movimento. Ou seja, todas as comunas da província de Santiago e mais seis que fazem parte da área urbana metropolitana: San Bernardo, Buin, Puente Alto, Lampa, Colina e Padre Hurtado. Fonte:  T13- Miércoles 13, mayo 2020 | 12:18 hrs

Comentário: População de Santiago e região metropolitana – 8 milhões
No Chile utiliza o sistema de quarentena dinâmica. Faz o teste, analisa a regiâo, se houver novos casos acima de alguns parâmetros comparativos,  isola a região ou bairro.
Casos COVID-19 no Chile
Casos totais acumulados
Casos novos Totais
Casos
novos com sintomas
Casos novos sem sintomas
Óbitos

Recuperados
34.381
2.660
2.152
508
346
14.865
Testagem
Teste - PCR nas últimas 24 h - 10.410
Testes totais de PCR - 313.750

Coronavírus: Dados da Prefeitura de São Paulo até 12 maio


terça-feira, 12 de maio de 2020

Coronavírus: A difícil volta à normalidade pós isolamento na Coreia do Sul

Na Coreia do Sul, 34 novos casos de coronavírus foram confirmados, o maior número diário em um mês.

Desses novos casos, anunciados no domingo, 26 foram infecções transmitidas internamente e oito foram importados, segundo os Centros de Controle e Prevenção de Doenças da Coreia (KCDC).

Foi o número mais alto registrado em um só dia desde 9 de abril. Depois de ter sido o primeiro país a combater a pandemia fora da China, a Coreia do Sul registrou zero ou muito poucos casos domésticos nos últimos 10 dias, com a contagem diária pairando em torno de 10 ou menos nas últimas semanas.

O ressurgimento ocorreu após um homem em torno de 20 anos ter visitado várias casas noturnas em uma mesma noite antes de ser diagnosticado com o coronavírus.

O surto levou a cidade de Seul a impor uma paralisação temporária imediata de todas as atividades de entretenimento noturno no sábado.

As autoridades disseram que estão buscando localizar 1,5 mil pessoas que foram às boates. Pediram também que qualquer que tenha ido a esses locais se isole por 14 dias e realize um teste para confirmar seu diagnóstico.

Os novos casos ocorrem em um momento em que a Coreia do Sul começava a flexibilizar algumas restrições de isolamento social, buscando reabrir totalmente escolas e empresas.

O presidente Moon Jae-in alertou para uma segunda onda da epidemia no final deste ano, dizendo que o novo surto evidencia os riscos de que o vírus possa se espalhar amplamente a qualquer momento.

"Não acabou até acabar. Nunca devemos baixar nossa guarda em relação à prevenção de epidemias ", disse ele em um pronunciamento na TV marcando o terceiro aniversário de sua posse.

"Estamos em uma guerra prolongada. Peço a todos que cumpram as precauções e regras de segurança até que a situação termine, mesmo depois de retomar a vida cotidiana."

Testes em massa e rastreamento de contatos de pacientes infectados ajudaram a quarta maior economia da Ásia a conter a epidemia em grande parte sem recorrer ao confinamento generalizado de sua população. Fonte: UOL Noticias - 11/05/2020 11h30

Comentário: Como será no Brasil? Ainda estamos em dúvida quarentena dura ou soft? Estamos no comportamento estouro da manada? Testar ou não testar?
Coreia do Sul
População – 52 milhões
Total de casos – 10.936
Mortes - 258

Coronavírus: Situação do Brasil até 12 de maio

Coronavírus – COVID 19 - BRASIL
12/05/2020
11/05/2020
Hospitalização
92.593
89.429
Novas confirmações
xx
xx
Óbitos
12.400
11.519
Óbito em investigação
2.050
1.897
Óbito/no decorrer dos últimos dias
206
162
Novos óbitos registrados
881
396
Total de casos
177.589
168.331
Novos casos registrados
9.258
5.632
Recuperados
72.597
67.384
Taxa de letalidade
7,0%
6,8%

Fontes: Agência Saúde - Publicado: Terça, 12 de Maio de 2020, 19h21; Agência Saúde - Publicado: Segunda, 11 de Maio de 2020, 20h14
 
 

Coronavírus: Situação do Estado de São Paulo até 12 de maio

Coronavírus – COVID 19- ESTADO DE SÃO PAULO
12/5/2020
11/5/2020
Internados em UTI
3.720
3.871
Internados em enfermaria
5.815
5.877
Óbitos
3.949
3.743
Óbitos/dia
xx
xx
Total de casos confirmados
47.711
46.131
Novos casos
xx
xx
Taxa de letalidade
8,27%
8,11%
Índice de isolamento no Estado
xx
48%
Índice de isolamento na Capital
xx
xx
Taxa de ocupação dos leitos de UTI no Estado de São Paulo
69,10%
68,20%
Taxa de ocupação dos leitos de UTI na Grande São Paulo
85,70%
89,60%
Municípios afetados
xx
414
Interior – 12/05/2020
Segundo o secretário de Desenvolvimento Regional, Marco Vinholi, o novo coronavírus tem se propagado com muita velocidade pelo interior do estado. Ele voltou a dizer hoje que, se continuar nesse ritmo, até o final do mês de maio todas as 645 cidades do estado terão casos confirmados da doença.
"O número de casos cresceu quase 100% ao longo dos últimos 11 dias, ou seja, dobrou o número de casos no interior do estado. Tivemos, na última semana de abril, uma aceleração de 40 novas cidades com casos de coronavírus. E, na primeira semana de maio, já tivemos a incidência de 85 novas cidades", disse. Fontes: Portal do Governo -Ter, 12/05/2020 - 15h56; Portal do Governo Seg, 11/05/2020 - 16h31